衢州市中医医院成立于1992年，是一家中医、中西医结合的综合性“国标”二级甲等中医院。医院占地50亩，建筑面积2万余平方米，是一个环境优雅的现代化医院。

衢州市中医医院现有专业技术人员285名，其中高级卫技人员48名；国家级名中医1名，市级名医、学科带头人9名；开设内科、神经康复科、外科、骨科、、妇产科5个病区和6间手术室；针灸推拿科为省中医重点学科，中西结合肛肠科、脊柱病专科、中西结合肾病科为省重点中医建设专科；医院设有重症监护中心（ICU）、手外科中心、中西医结合肛肠中心、血液透析中心、针灸推拿康复中心、中西医结合肿瘤诊治中心、健康体检中心；设中、西医门诊及医技科室50余个。

衢州市中医医院注重发展中医特色，开展了“龙氏正骨手法”治疗颈椎病、温针治疗单纯性肥胖、“靳三针疗法”治疗小儿脑瘫及老年性痴呆、“冬病夏治”、“冬病冬防”、保健推拿、中药腹膜透析等特色项目；开设了中医膏方门诊，为群众祛病强身量身定制针对性的滋补膏方。

衢州市中医医院开设名医馆，集中院内名医及高级职称医务人员坐诊，并邀请省内外知名专家前来坐诊，为患者提供优质的医疗和服务。

衢州市中医医院拥有国内先进的CT机、计算机数字X线成像系统（CR）、全自动生化仪、血透仪、全能麻醉机、监护仪、等离子电切镜、LEEP刀、椎间盘镜、腹腔境、电子胃镜、肠镜、鼻窦镜、支气管镜、24小时动态心电图和动态血压分析仪、肺功能仪以及各类进口超声诊断仪等医疗设备。

荣获省、市科研课题立项30多项，获市政府科技进步二等奖1项，三等奖3项；被授予“省级文明中医院”、“爱婴医院”、“省重点建设中医院”、“职业道德建设先进单位”、“省卫生先进单位”和“市科技工作先进单位”等称号。

2005年，医院被衢州市政府确定为衢州市惠民医院，为低保、困难户提供基本医疗保障。