高邮市中医医院是一所二级甲等中医院，是全国农村中医工作先进市的龙头单位，医院位于市中心、交通便捷,环境优美，占地面积20004平方米;建筑面积21835平方米。于1979年3月正式开诊，建院历史虽短，但管理严，发展快，现已成为设有200张床位，28个临床医技科室，15个专病门诊，三个扬州市级重点中医专科：中医骨伤科，中西医结合肾病科，中西医结合儿科。中西医结合肿瘤科、儿科作为医院的特色专科，在广大患者心中享有很高的声誉。医院成为以中医为主，中西医结合预防、医疗、教学、科研为一体的综合性、非营利性国有中医医院。
高邮市中医医院技术力量雄厚，医疗设备先进，是全市中医医教研的中心。医院现有职工298人，卫技人员243人，其中，高级职称33人，中级职称108人，初级职称102人。装备有德国西门子医用直线加速器，双排螺旋CT机，800MA数字遥控诊断X光机，柯达DR3000摄片机，美国、德国产彩超、呼吸机、电子胃肠镜及细径纤维胃镜、纤维结肠镜、腹腔镜、高压氧舱、B超X光双定位体外碎石机、高频移动式手术X射线机、高频移动式X射线摄影机等一大批先进诊疗设备。中医骨伤科注重继承和发展省名中医许氏骨伤科的优势，运用手法整复、小夹板固定治疗各类骨折颇具特色，同时积极引进新设备，开展骨科的各种置换、修复、矫治等手术，在本市及周边兴化、宝应、江都、金湖、泰州等地区都有一定的影响。内科、妇科、儿科、痔科以及针灸推拿科在全市影响较大。中医治疗肾脏病、关节病、糖尿病、肿瘤等疗效明显。在日本友人关心支持下创建的血液净化中心于1992年建成使用，现有床边机12台，配备有美国产反渗水处理系统等设备，优良的服务吸引了市内外患者。
30年来,医院获县(市)级以上科技成果奖近10项，其中“小腿弹性压缩带”获国家专利。在全国及省级专业学术期刊发表论文300余篇，并多次获得省、市、县级文明医院、医院管理年、“百杯” 赛先进单位等光荣称号。
高邮市中医医院还设有国内一流，并通过了省药监局专家组评审验收，符合GMP标准的中药制剂室。现生产13种剂型，近60个品种的中药制剂。许氏膏药、飞廉糖浆、止嗽合剂等，疗效独特，享誉市内外。
高邮市中医医院还分别是南京中医药大学，扬州大学医学院的教学实习基地和教学医院，为培养中医人才作出了积极贡献。
经过数年来的改革和开拓创新，高邮市中医医院从无到有，从发展到壮大，其综合实力在扬州县市二级中医医院当中位于前列。医院“十一五”发展蓝图已绘制，那就是到2010年，医院将建设成为中医特色明显，专科优势突出，布局基本合理、临床科室较为齐全、功能完善、技术先进、服务便捷高效，能够为人民群众提供完善有效、质量优良的中医医疗保健服务的基本现代化中医医院。