衡阳市传染病医院创建于1942年（原名仁爱医院），位于湘江与蒸水汇流的青草桥头，毗邻石鼓文化公园。是湘南地区唯一一所集医疗、教学、科研、预防为一体的非营利性大型传染病专科医院，中华医学会衡阳市传染病结核病学会挂靠单位，中国人民解放军全军传染中心协作医院，南华大学传染病临床教学基地，衡阳市医保定点医院。

衡阳市传染病医院环境舒适优雅，交通便利，收费合理，现开设临床、医技科室20多个，编制病床288张，有各类专业技术人员248人，其中高中级职称100余人，并有享受政府特殊津贴的省、市学科带头人数人。

肝病科、结核科、急性传染科是医院的重点专科。在肝病的预防和治疗方面，60年来积累了丰富的经验，对甲、乙、丙、丁、戊、庚六型肝炎的诊断与治疗水平在全国居于前列。在衡阳地区，最早提出原发性腹膜炎的诊断学说，率先使用乙肝疫苗预防病毒性乙型肝炎，第一个在衡阳地区发现丙肝和庚肝并获市科技进步奖；对重症肝炎、肝硬化腹水等疑难肝病，采用中西医并举，使重症肝炎抢救成功率逐年升高。采用静脉套扎技术，治疗肝硬化并食道静脉破裂出血。采用新型抗病毒疗法，治疗乙肝及丙型肝炎达到国内先进水平。

对结核病的治疗，以收治肺结核、结核性胸膜炎并胸腔积液及脑、肾、骨结核为主，与国际标准化疗法接轨，疗程短，效果好，使初发结核病的治愈率明显提高。在省内首创“大管腔引流排气术”治疗自发性气胸，手术小、无痛苦。

急性传染病科主要收治伤寒、菌莉、急慢性肠炎、霍乱等肠道传染病，麻疹、流行性腮腺炎、小儿肺炎、白喉等呼吸道传染病以及破伤风、流脑、病脑、乙脑、结脑等中枢神经系统感染性疾病，尤其是对伤寒的早期诊断和治疗，在省内一直处于领先水平。对乙脑、破伤风、麻疹、腮腺炎合并脑膜炎的治愈率在同行处于领先水平。此外该院是衡阳地区唯一保留和使用白喉抗毒素的医院。

衡阳市传染病医院专科检查设备先进齐全，拥有号称“生化之冠”的美国进口贝克曼大型全自动系列生化分析仪、日立500毫安X光机、日立彩超、瑞典产自动血细胞分析仪、日产欧林巴期纤维支气管镜及胃镜、电解质分析仪、尿液分析仪等一大批先进医疗检测设备。拥有分子生物实验室，率先在省内开展获得美国FDA认证的乙肝病毒DNA定量分析；在衡阳地区，率先开展荧光染色法查结核杆菌及耐药性结核培养和结核药敏试验等技术，为临床医疗诊断提供全面准确的检测服务。

衡阳市传染病医院坚持走专科特色之路，积极实施“科教兴院”战略，加大人才培养力度，每年派多人到北京、上海、武汉、长沙等全国知名医院进修学习，发展和培养了一批高素质的技术队伍，形成了以传染病学科带头人为先导的湘南地区最大的肝病、结核病专家群体。

衡阳市传染病医院坚持“一切以病人为中心”的办院宗旨，坚持“院有特色，科有重点，人有专长”的办院方针，坚持“人道博爱，求真务实、敬业奉献”的管理理念，在狠抓医院质量、诊疗水平的同时，强化职工职业道德和优质服务。近年来，该院先后被授予“市文明卫生先进单位”、“市十佳医院”、“市文明优秀服务医院”、“医疗安全管理最佳单位”等光荣称号。