北京中医药大学第三附属医院的前身是北京冶金医院，始建于1964年，1991年11月划归冶金工业部。是北京市定点中西医结合医院。北京足踝外科研究所、朝阳区肢体残疾治疗中心设在该院。

2006年7月28日划转至北京中医药大学，9月15日命名为北京中医药大学第三附属医院。2007年7月17日成为北京中医药大学第三临床医学院。并相继成立脑病、骨伤国家级重点专科和中西医结合肿瘤治疗中心。

北京中医药大学第三附属医院占地面积23000平方米，建筑面积41000平方米，医院设有病床300余张，有普通病房、干部病房、CCU及ICU病房，全院共有医疗专业24个。我院现有正式职工380 人，大学本科以上学历147人，其中博士研究生17人（5人博士后），硕士研究生18人，有中级以上职称人员240人，其中正高级职称9人，副高级以上职称53人。

北京中医药大学第三附属医院的医疗设备齐全，拥有14兆医用直线加速器、CR、X刀、CT、1000毫安X光机、惠普5500彩色多普勒超声、心电监护系统、血压监测系统和高压氧舱等大型医疗设备。

北京中医药大学第三附属医院环境清洁、优雅、病房宽敞明亮。2007年底，计划新建门诊楼10000余平米，2008年计划新建病房楼18000平方米，床位扩增至500余张。

将发展成为500张床位以上的中西医结合的综合性三级医院。北中医大三院将成为花园式的、综合性的现代化中西医结合医院。全院职工将以“三个代表”重要思想为指导，全面落实科学发展观，为创建新型、和谐、一流的中西医结合医院而奋斗。