复旦大学附属眼耳鼻喉科医院成立于1952年7月1日，是由中国红十字会第一医院及中山医院的眼科和耳鼻喉科合并而成的，是上海医学院的一所专科性的教学医院。

1955年更名为上海第一医学院附属眼耳鼻喉科医院。1985年改名为上海医科大学附属眼耳鼻喉科医院。1999年上海医科大学与复旦大学合并后，医院更名为复旦大学附属眼耳鼻喉科医院。

坐落于汾阳路的眼耳鼻喉科医院是一所集医疗、教学、科研为一体的上海市三级甲等专科医院，并于2004年成为复旦大学首家通过ISO9001认证的医院。

复旦大学附属眼耳鼻喉科医院占地面积33亩，设有眼、耳鼻喉、放疗、麻醉、口腔、激光、急救、整形八个临床科室和放射、病理、药剂、检验、营养等五个医技科室；眼科和耳鼻喉科是国家教育部重点学科，也是国家教委批准的首批硕士、博士生培养点，博士后流动站，并建有上海市听觉医学临床中心、上海市眼科临床质量控制中心。

耳-颅底显微外科、玻璃体视网膜疾病的手术治疗已达国际先进水平；眼视光学、青光眼、白内障人工晶体、角膜移植、头颈肿瘤外科、临床听力学和听觉、嗓音康复等均达国内先进水平。医院还开设鼾症、中医肿瘤、过敏性鼻炎以及眼肿瘤整形、干眼症、角膜病、糖尿病性眼病以及集放疗、放射和头颈外科于一体的肿瘤会诊等十八个专科门诊。

随着复旦大学附属眼耳鼻喉科医院的不断发展，2002年和2003年医院开设了以汾阳路总院为核心的宝庆路分部和浦东分院，并建立了眼视光学中心、听觉言语康复中心、多导睡眠监测室和高压氧舱治疗室等。2004年新建成的门诊大楼。

复旦大学附属眼耳鼻喉科医院将努力创建国内领先、亚洲一流的专科医院，成为中国乃至亚洲的眼耳鼻喉科的学术中心和人才培养基地。