莆田市皮肤病防治院系莆田市卫生局主管的公立非营利性医疗机构。为莆田市市一级预防和治疗麻风病、性病及皮肤病的唯一专科防治院。负责全市麻风病、性病和皮肤病的预防、治疗和监测工作。既承担公共卫生职能，又有临床诊疗任务，是卫生部定点的国家级艾滋病和性病监测哨点单位。

莆田市皮肤病防治院内设皮肤科、性病科、麻风防治科、药剂科、制剂室、检验科、康复理疗科、院感科、护理部、财务科、办公室、保卫科等12个职能科室。现有工作人员53人，专业技术人员46人，其中高级卫技职称9人，中级职称12人。

莆田市皮肤病防治院院设有皮肤病、性病专家（主任）门诊及普通门诊。使用具有特色的经省药监局批准的自制外用药品。还设有光疗室、美容室、微波激光室、表皮移植治疗白癜风等医技科室。拥有较完善的诊疗设备和高素质人才，能对各种皮肤病、性病进行检查、确诊和治疗工作。

因莆田市皮肤病防治院院原有院址拆迁改造，临时搬迁至莆田市肿瘤医院内（学园北街99号）。目前正在进行新院重建。